Anh trưởng thành từ lò đào tạo của bóng đá Đồng Tháp sở hữu chiều cao khá tốt.Năm 2012 thi đấu xuất sắc cho Câu lạc bộ bóng đá Đồng Tháp nên anh được HLV Falko Götz chọn là thủ môn của đội U23 Việt Nam tại SEA Games 26 và chiếm luôn vị trí số 1. Sau kỳ SEA Games 26 anh đánh mất đi chính mình.

Giai đoạn 2 V-League 2015 anh bất ngờ về chơi cho Câu lạc bộ bóng đá Cần Thơ cho đến năm 2017.

Anh ra mắt đội tuyển quốc gia Việt Nam vào ngày 22 tháng 3 năm 2013 trong trận gặp Hồng Kông.[1] Trong trận giao hữu với câu lạc bộ Arsenal tại sân Mỹ Đình ngày 17 tháng 7 năm 2013, hiệp 2 anh được vào sân thay thế thủ môn Dương Hồng Sơn. Đến phút 89, anh bị thẻ đỏ trực tiếp phải rời sân.

Tại HAGL Trần Bửu Ngọc là người Đồng Tháp thứ 6 đi theo tiếng gọi của HAGL. Trong quá khứ, những đồng hương của Bửu Ngọc gồm Đoàn Việt Cường, Phan Thanh Bình, Dương Văn Pho, Nguyễn Minh Nghĩa và Nguyễn Quý Sửu đã để lại khá nhiều dấu ấn ở phố Núi.

Không giống như những đàn anh, Bửu Ngọc gia nhập HAGL khi anh đang chấp chới trong sự nghiệp. Lại kể chuyện vẫn chưa cũ, kết thúc giai đoạn 1 V.League 2019, Trần Bửu Ngọc khăn gói rời Thanh Hóa với những chuyện lùm xùm nội bộ. Thủ thành sinh năm 1991 này rời xứ Thanh với tâm trạng chẳng biết đi đâu về đâu khi mọi đội bóng đã chốt sổ. Hoặc một vài lời đề nghị bị anh từ chối vì chê lương thấp, tiền lót tay không cao. Cho đến giai đoạn 2, Bửu Ngọc ngược ra Phố Hiến để chơi tại giải hạng Nhất.

Phải thừa nhận rằng, Bửu Ngọc góp một phần không nhỏ giúp Phố Hiến giành chiếc vé dự play-off lên V.League 2020 (sau đó để thua Nam Định). Tuy nhiên, bấy nhiêu đó không đủ để Phố Hiến giữ anh bằng mọi giá. Đã có những thông tin cho rằng, Ngọc đã trên đường đến với CLB TP.HCM. Cụ thể, đôi bên đã đạt được thỏa thuận nhưng phút chót, mối lương duyên này đổ bể vì một cái gì đó mà chính Ngọc cũng không hiểu.

Ra sân đội tuyển quốc gia